熒光定量分析PCR技術(shù)的特點
PCR技術(shù)的優(yōu)點
1.操作簡便
應(yīng)用PCR方法的早期階段操作縈瑣,因為使用的聚合醉是大腸桿菌DNA聚合酶I的大片段,即Klenow片段,而不是耐高溫的TaqDNA聚合酶,而且操作也未實現(xiàn)自動化。目前使用的是耐高溫的TaqDNA聚合酶,其操作也實行了電腦控制的DN八擴(kuò)增儀的自動化,只要將擴(kuò)增反應(yīng)所需要的特定程序輸入DNA自動擴(kuò)增儀,操作臺PCR操作箱把反應(yīng)所需要的全部材料混合均勻,置入儀器內(nèi),反應(yīng)就會按照所輸入的正確程序進(jìn)行。如果需要,還可隨時予以調(diào)整。
2. 省時
應(yīng)用TaqDNA聚合酶時,單核昔酸摻入的速率較高,75℃一80℃時,每個酶分子每秒鐘可完成150個核昔合成.PCR每一周期需數(shù)分種,所以,一般取用20一30個周期能使目的DNA達(dá)到數(shù)百萬倍擴(kuò)增的反應(yīng)只需數(shù)小時即可完成.在基因分離,突變體構(gòu)建,DNA測序等方面,PCR方法均較之常規(guī)方法快速得多.例如,乾蕓GENIN PCRroom-1st操作臺PCR操作箱用常規(guī)方法建立cDNA文庫或染色體DNA文庫來分離基因,需花幾個月時間,用PCR方法只要1一2個周;用M13法構(gòu)建突變體需l一2個月,用PCR法僅用數(shù)天;PCR方法擴(kuò)增的目的DN段可直接用作測序分析,較常用的通過克隆,培養(yǎng)擴(kuò)增,純化制備等步驟獲得測序片段更為簡便,省時。
3.靈教度高
PCR產(chǎn)物的生成,是以指數(shù)方式增加的,所以欲擴(kuò)增pg量級的起始物到雌水平成放大真核細(xì)胞單拷貝基因,通過PCR方法都是不難完成的。PCR方法還可用單一雙倍體細(xì)胞,一根頭發(fā),甚至單一精子進(jìn)行DNA定型。
4.特異性強
作為引物的寡聚核昔酸與模板結(jié)合的正確性是決定反應(yīng)產(chǎn)物是否特異的關(guān)鍵。TaqDNA聚合酶耐高溫的性質(zhì),使得反應(yīng)中引物與模板退火的步驟可以在較高的溫度下進(jìn)行,結(jié)合的特異性大大增加,被擴(kuò)增的目的DN段也能保持很高的正確程度。
5.對原始材料質(zhì)t要求低
由于PCR技術(shù)有高靈敏度和強特異性,故僅含量(Pg,ng水平)的目的DNA的粗制品或者總DNA,就可以作為反應(yīng)起始材料來獲取目的DNA擴(kuò)增產(chǎn)物。部分的降解的DNA材料也可以通過PCR多次反應(yīng)周期,最終得到所需的含全長序列的DN段.用石蠟包埋的組織切片,甚至幾千年前出土的文物,只需經(jīng)過適當(dāng)?shù)奶幚恚|GENIN PCRroom-1st操作臺PCR操作箱都可用PCR技術(shù)進(jìn)行目的DNA的擴(kuò)增,這樣就有可能對系統(tǒng)保存的病理材料進(jìn)行檢測,解決以前無法解決的問題,同時,這一特性也使PCR技術(shù)應(yīng)用到考古學(xué),人類學(xué)等領(lǐng)域成為可能。
6.PCR技術(shù)應(yīng)用范圍廣
PCR技術(shù)可應(yīng)用于核酸結(jié)構(gòu)和功能研究的各個領(lǐng)域,如DNA一級結(jié)構(gòu)的測定,基因突變,基因工程,蛋白質(zhì)工程及基因治療等各個方面,都有著重要的應(yīng)用.PCR技術(shù)的出現(xiàn),使這些領(lǐng)域發(fā)生了顯著的變化。
PCR技術(shù)的缺點
1、假陽性問腸
如果PCR反應(yīng)系統(tǒng)中,既使污染一個拷貝的DN段,如果和引物結(jié)合以后,經(jīng)過擴(kuò)增反應(yīng),則判為陽性。但這種結(jié)果是一種假陽性結(jié)果。因此,反應(yīng)系統(tǒng)中的樣品,試管,移液器及試管要求確實無DN段的污染,否則其結(jié)果判定十分困難。
2.單核普酸的錯誤接人
由于TaqDNA聚合酶缺乏3"5’核酸外切酶的活性,因而不能糾正反應(yīng)中發(fā)生的錯誤的核昔酸摻入;與大腸桿菌DNA聚合酶1的Klenow片段相比,用前者的反應(yīng)發(fā)生錯誤摻入的較多.錯誤核昔酸摻入的頻率還受反應(yīng)條件的影響,所以對僅由TaqDNA聚合醛引發(fā)的錯誤摻入很難精確估計.TindanK.R.估計是每9000個核昔酸摻入中發(fā)生一次錯誤,乾蕓GENIN PCRroom-1st操作臺PCR操作箱而合成41000個核昔酸可能導(dǎo)致一次框碼移位。但是,這種錯誤并不意味著PCR產(chǎn)物一定會發(fā)生序列改變,InnisM,A.發(fā)現(xiàn),錯誤摻入的堿基有終止鏈延伸作用的傾向,這就使得發(fā)生了的錯誤不會再擴(kuò)大。這一點對PCR結(jié)果有利。
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